Laboratorio de Sistemática y Biogeografía | Correo electrónico


J. Salvador Arias

Estudiante de pregrado




Laboratorio de Sistemática y Biogeografía
Escuela de Biología
Universidad Industrial de Santander
A. A. 678 Bucaramanga, Colombia

Correo electrónico: jsa@ciencias.uis.edu.co


Mi principal interés, como estudiante de biología, es la cladística numérica, la filosofía de la ciencia y las chinches (Hemiptera, Heteroptera)

En la actualidad pertenezco al Laboratorio de Sistemática y Biogeografía, bajo la dirección de Daniel Miranda donde trabajo en mi propuesta para proyecto de grado, implementando software y en temas metodológicos de la sistemática.


Propuesta de grado (proyecto)
Otros proyectos
PP vs IW (articulo, software)
Parsimonia de mínimos cuadrados (proyecto de software)

Métodos para Seleccionar Funciones de Confianza en Cladística
(Resumen del proyecto para propuesta de grado)

Se busca implementar protocolos que permitan seleccionar entre parsimonia de pesos iguales, parsimonia bajo pesos implicados (Goloboff 1993, 1995), y pesos basados en confianza (pesaje sucesivo [Farris 1969, 2001], pesaje de pseudo-replicas [Farris 2001, Kjer et al. 2001, 2002]). Se pretende explorar la relación entre estos métodos y la falsación sofisticada sensu Lakatos (1982).

Farris, J.S. (1969) A successive approximations approach to character weighting. Syst. Zool 18: 374-385.
Farris, J.S. (2001) Support Weighting. Cladistics 17: 389-394.
Goloboff, P.A. (1993) Estimating character weights during tree search. Cladistics 9: 83-91.
Goloboff, P.A. (1995) Parsimony and Weighting: A reply to Turner and Zandee. Cladistics 11: 91-104.
Kjer, K.M., et al. (2001) Phylogeny of Trichoptera (Caddisflies): Characterization of signal and noise within multiple datasets. Syst. Biol. 50: 781-816.
Kjer, K.M., et al. (2002) Phylogeny of caddisflies (Insecta, Trichoptera). Zool. Scripta 31: 83-91.
Lakatos, I. (1982) La metodología de los programas de investigación científica. Alianza (Madrid).

Parsimonia de Perfiles (PP) vs. Parsimonia de Pesos Implicados (IW)
(Articulo publicado en Cladistics 20: 56-63 con
Daniel Miranda)
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Demostramos que las motivaciones para PP (Faith y Trueman 2001) son las mismas que promovieron la implementación de IW (Goloboff 1993, 1995). Además, ambos métodos utilizan funciones cóncavas de homoplasia, pero PP esta sesgado por la presencia de caracteres con entradas inaplicables/desconocidas y caracteres multiestado.

Faith, D.P., Trueman, J.W.H. (2001) Towards an inclusive phylosophy for phylogenetic inference. Syst. Biol. 50: 331-350.
Goloboff, P.A. (1993) Estimating character weights during tree search. Cladistics 9: 83-91.
Goloboff, P.A. (1995) Parsimony and Weighting: A reply to Turner and Zandee. Cladistics 11: 91-104.

Se implemento una serie de programa para DOS: PP, disponibles como ejecutables. El código esta disponible para quien me escriba.

Parsimonia de Mínimos Cuadrados
(Proyecto de software con
Daniel Miranda)

Un programa para evaluar los cambios en los nodos usando Parsimonia de Mínimos Cuadrados, incluyendo la modificación de Sharkey (1999).

Versión publica ˇPROXIMAMENTE!

Sharkey, M.J. (1999) Transition confidence and modified mean values: confidence measures for hypothesis of character state change between nodes and ancestral state optimizations. Cladistics 15: 113-120.


Actualización 12 Octubre 2005

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