Algunas de las utilidades producidas en el laboratorio


PDCalcula la distintividad filogenética usando una matriz de BPA primario multiplicada por el vector de las longitudes de las ramas (no se necesita transponer o pasar a binario). Se usó para responder la critica de Faith et al (2004). ver Posadas et al (2004).

Pae/BPAGenera una matriz de PAE/BPA usando el formato de PD/Richness.


PPCalcula el perfil de una seria de árboles (a partir de árboles al azar o para una matriz de caracteres binarios mediante la ecuación de Carter et al (1990)) y el valor de PP para un(os) árbol(es). ver Arias & Miranda-Esquivel (2004).

Richness: Calcula indices filogenéticos y complementariedad para establecer prioridades de conservación.  Para más información ver Posadas et al (2001).

2->P Estos programas se utilizan para generar los códigos de eliminación de caracteres y taxa (=jackknife) necesarios para diferentes macros de TNT

Yuu-PRC Grupo de macros para TNT para realizar diferentes búsquedas parciales. Trabajan en conjunción con los programas de "2->p"

SF2/KoF Estos programas se utilizan para leer los arboles producidos tras la eliminación de caracteres y taxa (=jackknife) y particiones generados por los diferentes macros "yuu-PRC" para TNT. Miden la cantidad de nodos compartidos

MK/KI Estos programas se utilizan para leer los arboles producidos tras la eliminación de caracteres y taxa (=jackknife) y particiones generados por los diferentes macros "yuu-PRC" para TNT. Comparan el ajuste de los caracteres.

2tts Este programa lee un árbol en formato de NONA (TNT) y elabora una salida para TAS.

from Here to Eternity Este programa lee un archivo de entrada en formato tf o nelson05 y genera una salida en formato de NONA (TNT) para hacer BPA (el primario)